这里面有两个难点，一个是草方格的密度很大，所以需要的工作量非常的惊人，而且沙漠地区的工作环境是非常的恶劣的，扬沙、太阳的灼烧，缺水的环境等等，对工人在这里工作简直是一种折磨。
而且，草方格建立起来之后，里面的灌木灌溉需要的水源也是一个问题。
不是每一个沙漠下面都有地下水，而且不是每一个沙漠治理的时候都能开采地下水，如果地下水丰富的话那还好说，就像是撒哈拉沙漠，直接取用地下水不会产生什么问题，但是像那些地下水不是很丰富的地区，如果直接取用地下水的话，会造成地下水水位下降，而如果地下水水位下降了的话，种植的植物需要长时间的灌溉，直到他们的根系长得足够长，接触到地下水位之后，它们才能够拜托对人工灌溉的依赖。
而这就带来了整个工期的不确定性和延长，工期延长了，人力消耗会更大，水资源消耗也会更大，而沙漠地区的降雨量很少，水分蒸发却很严重，等于是从地下开采的水越多，消耗的水越多，蒸发的水越多，流失的水也越多，地下水位也会更加下降，这是一个恶性循环！
为了避免这种情况的出现，那怎么办呢？
答案是从外地引水过来，库布齐沙漠的北边是黄河，虽然距离黄河大概还有十公里左右的距离，但是这却并不算是很远，因为靠近水源，所以库不齐的治理才会有可能实现！
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